ساماندهی موسسات غیرانتفاعی طرح جدید وزارت علوم است که از ابتدای دولت یازدهم مطرح شده و برای اجرای این طرح کش‌و قوس‌های فراوانی به وجود آمده است که وضعیت نامشخص این موسسات در سال‌های آینده را نشان می‌دهد.